除了重置葵青貨櫃碼頭外，坊間有團體建議，於碼頭上蓋加建平台以興建房屋，令現有碼頭可繼續運作之餘，同時可增加住宅單位，料涉及18萬伙新增供應。

貨櫃存放區上方 設平台建住宅

團體建議，於海濱60米至80米以外，貨櫃箱存放地區上方20米至30米位置，興建平台用作建造住宅單位，下方空間繼續存放貨櫃，可以更有效善用碼頭現有用地，亦毋須搬遷及填海重置碼頭。

本地著名建築師嚴迅奇於公開研討會曾指出，若將整個碼頭發展，可興建達18萬伙，與9個太古城的規模相若，若方案落實，最快可於7至8年內，可以正式建屋。

商貿樓層分隔 住宅及碼頭

另外，香港工程師學會前會長周明權認為，現不少住宅物業設於港鐵站或公共交通交滙處上蓋。假設於碼頭興建上蓋，並以商貿樓層分隔住宅及下層貨櫃碼頭，實際上與現有的模式未有不同。

不過，於碼頭上蓋加建平台，亦要面對多重挑戰。要在發展上蓋時，不影響碼頭的持續運作，會涉及複雜技術及緩解措施。同時要與業權人進行磋商，探討是否有權參與發展計劃，土地用途亦要進行改劃。

至於配套方面，碼頭加建住宅後，區內人口勢急增，並產生額外交通流量，有需要檢討區內運輸系統發展，如擴大及改裝港鐵青衣站、葵芳站和荔景站等。

除此之外，葵青貨櫃碼頭上蓋發展住宅，亦要評估碼頭運作時產生噪音、眩光及空氣質素等等問題，對上蓋居民的影響。